Первая хоккейная команда Барнаула была основана в 1954-м году и называлась "Спартак".

В 1959-м году команда была передана профсоюзной организации Алтайского моторного завода и переименована в "Мотор". Под этим названием команда участвовала в соревнованиях до 2006-го года, после чего клуб был признан банкротом и ликвидирован.

Летом 2006-го года профессиональная команда перешла на баланс Краевого автономного учреждения "Алтай" и Правительства Алтайского края и стала носить имя "Алтай". Выступала в Российской хоккейной лиге (РХЛ) и Первенстве Высшей хоккейной лиги (ВХЛ-Б).

В 2019-м году в результате ребрендинга, проведённого Министерством спорта Алтайского края, и в рамках государственно-частного партнёрства, клуб был переименован в "Динамо-Алтай".

За 4 сезона выступлений в Первенстве ВХЛ "Динамо-Алтай" три раза становился бронзовым призёром турнира (2019/2020, 2020/2021, 2021/2022), дважды - победителем регулярного сезона (2020/2021, 2021/2022), а также серебряным призёром (2022/2023).

В 2023-м "Динамо-Алтай" был включён в число участников Всероссийской хоккейной лиги (ВХЛ), где с тех пор и выступает.